ここでは、基礎と基礎パッキンと土台の関係について少し述べてみたいと思います。
基礎パッキンの役割は、
・床下の換気（通風）の役目をする。
・基礎と土台との間を離すことにより、基礎からの湿気が直接土台に及ばないようにする。
などが考えられます。
基礎パッキン
アンカーボルトやホールダウン金物は、あらかじめ基礎工事で施工されていますので、その位置にあわせて土台を伏せ（取付）ていきますが、その前に基礎パッキンを配置しておきます。
１階床伏図
上記掲載の図面は一つの例です。参考にしてください。